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Sequence NM_003340

ACCAAGTGAGGAAACTGGGGGACGCTGTGGGGAGGGGCGTGGGGCTGGATCGCGCAGCGGCTGCTTCCTTTACCTTCCTCCCATGGTCTCCTTCCGGTTC
TCGATGCTTCTCTGAGCCTAAGGGTTTCCGCCACTCGTTCACCCTCCCCCCAGCTCATGATCTTCCTCCCTCCCCCGCCCTCCTGGTCCAATCTCCGATC
TGTTTAGTAAGAAGGTGCTGTTCCGAGAAGGAGAAGGAAAAGGGCTTGACACGTATTCACTCGGCCCCGGACGTGGGAAGCAAGCCGTCTGGCTTCGGCC
TCACATCGGTCCTGTGCTCGGGACGGCGGCGTTGGCGGACTGATCCGCGGCGGTGAAGAGGCGCCTGTGTCTGGCAGAGCTGGTGTGAGACGAGACAATC
CTGCCCCGCCGCCGGGATAATCAAGAGTTTTGGCCGGACCTTTGAGCATACACCGAGAGAGTGAGGAGCCAGACGACAAGCACACACTATGGCGCTGAAA
CGGATTAATAAGGAACTTAGTGATTTGGCCCGTGACCCTCCAGCACAATGTTCTGCAGGTCCAGTTGGGGATGATATGTTTCATTGGCAAGCCACAATTA
TGGGACCTAATGACAGCCCATATCAAGGCGGTGTATTCTTTTTGACAATTCATTTTCCTACAGACTACCCCTTCAAACCACCTAAGGTTGCATTTACAAC
AAGAATTTATCATCCAAATATTAACAGTAATGGCAGCATTTGTCTCGATATTCTAAGATCACAGTGGTCGCCTGCTTTAACAATTTCTAAAGTTCTTTTA
TCCATTTGTTCACTGCTATGTGATCCAAACCCAGATGACCCCCTAGTGCCAGAGATTGCACGGATCTATAAAACAGACAGAGATAAGTACAACAGAATAT
CTCGGGAATGGACTCAGAAGTATGCCATGTGATGCTACCTTAAAGTCAGAATAACCTGCATTATAGCTGGAATAAACTTTAAATTACTGTTCCTTTTTTG
ATTTTCTTATCCGGCTGCTCCCCTATCAGACCTCATCTTTTTTAATTTTATTTTTTGTTTACCTCCCTCCATTCATTCACATGCTCATCTGAGAAGACTT
AAGTTCTTCCAGCTTTGGACAATAACTGCTTTTAGAAACTGTAAAGTAGTTACAAGAGAACAGTTGCCCAAGACTCAGAATTTTTAAAAAAAAAAATGGA
GCATGTGTATTATGTGGCCAATGTCTTCACTCTAACTTGGTTATGAGACTAAAACCATTCCTCACTGCTCTAACATGCTGAAGAAATCATCTGAGGGGGA
GGGAGATGGATGCTCAGTTGTCACATCAAAGGATACAGCATTATTCTAGCAGCATCCATTCTTGTTTAAGCCTTCCACTGTTAGAGATTTGAGGTTACAT
GATATGCTTTATGCTCATAACTGATGTGGCTGGAGAATTGGTATTGAATTTATAGCATCAGCAGAACAGAAAATGTGATGTATTTTATGCATGTCAATAA
AGGAATGACCTGTTCTTGTTCTACAGAGAATGGAAATTGGAAGTCAAACACCCTTTGTATTCCAAAATAGGGTCTCAAACATTTTGTAATTTTCATTTAA
ATTGTTAGGAGGCTTGGAGCTATTAGTTAATCTATCTTCCAATACACTGTTTAATATAGCACTGAATAAATGATGCAAGTTGTCAATGGATGAGTGATCA
ACTAATAGCTCTGCTAGTAATTGATTTATTTTTCTTCAATAAAGTTGCATAAACCAATGAGTTAGCTGCCTGGATTAATCAGTATGGGAAACAATCTTTT
GTAAATGCAAAGCTGTTTTTTGTATATACTGTTGGGATTTGCTTCATTGTTTGACATCAAATGATGATGTAAAGTTCGAAAGAGTGAATATTTTGCCATG
TTCAGTTAAAGTGCACAGTCTGTTACAGGTTGACACATTGCTTGACCTGATTTATGCAGAATTAATAAGCTATTTGGATAGTGTAGCTTTAATGTGCTGC
ACATGATACTGGCAGCCCTAGAGTTCATAGATGGACTTTTGGGACCCAGCAGTTTTGAAATGTGTTTATGGAGTTTAAGAAATTTATTTTCCAGGTGCAG
CCCCTGTCTAACTGAAATTTCTCTTCACCTTGTACACTTGACAGCTGAAAAAAAACAACATGGGAGTAATAATGGGTCAAAATTTGCAAAATAAAGTACT
GTTTTGGTGTGGGAGTTGTCATGAGGCTGTGTTGAAGTGACTTATCTATGTGGGATATTGAGTATCCATTGAAATGGATTTGTTCAGCCATTTACATTAA
TGAGCATTTAAATGCAACAGATATCATTTCAGGTGACTTAACATGAATGAATAAAAGTCAATGCTATTGGA
  • refseq_UBE2D3.F3 (forward primer)
  • refseq_UBE2D3.R3 (reverse primer)
  • Alternative acceptor

Frame 0

TK*GNWGTLWGGAWGWIAQRLLPLPSSHGLLPV
LDASLSLRVSATRSPSPQLMIFLPPPPSWSNLRS
V**EGAVPRRRRKRA*HVFTRPRTWEASRLASA
SHRSCARDGGVGGLIRGGEEAPVSGRAGVRRDN
PAPPPG*SRVLAGPLSIHRESEEPDDKHTLWR*N
GLIRNLVIWPVTLQHNVLQVQLGMICFIGKPQL
WDLMTAHIKAVYSF*QFIFLQTTPSNHLRLHLQ
QEFIIQILTVMAAFVSIF*DHSGRLL*QFLKFFY
PFVHCYVIQTQMTP*CQRLHGSIKQTEISTTEY
LGNGLRSMPCDATLKSE*PAL*LE*TLNYCSFF
DFLIRLLPYQTSSFLILFFVYLPPFIHMLI*EDL
SSSSFGQ*LLLETVK*LQENSCPRLRIFKKKNG
ACVLCGQCLHSNLVMRLKPFLTALTC*RNHLRG
REMDAQLSHQRIQHYSSSIHSCLSLPLLEI*GYM
ICFMLITDVAGELVLNL*HQQNRKCDVFYACQ*
RNDLFLFYREWKLEVKHPLYSKIGSQTFCNFHL
NC*EAWSY*LIYLPIHCLI*H*INDASCQWMSDQ
LIALLVIDLFFFNKVA*TNELAAWINQYGKQSF
VNAKLFFVYTVGICFIV*HQMMM*SSKE*IFCH
VQLKCTVCYRLTHCLT*FMQN**AIWIV*L*CAA
HDTGSPRVHRWTFGTQQF*NVFMEFKKFIFQVQ
PLSN*NFSSPCTLDS*KKTTWE**WVKICKIKY
CFGVGVVMRLC*SDLSMWDIEYPLKWICSAIYIN
EHLNATDIISGDLT*MNKSQCYW

Frame 1

PSEETGGRCGEGRGAGSRSGCFLYLPPMVSFRF
SMLL*A*GFPPLVHPPPSS*SSSLPRPPGPISD
LFSKKVLFREGEGKGLDTYSLGPGRGKQAVWLRP
HIGPVLGTAALAD*SAAVKRRLCLAELV*DETI
LPRRRDNQEFWPDL*AYTERVRSQTTSTHYGAE
TD**GT**FGP*PSSTMFCRSSWG*YVSLASHNY
GT**QPISRRCILFDNSFSYRLPLQTT*GCIYN
KNLSSKY*Q*WQHLSRYSKITVVACFNNF*SSF
IHLFTAM*SKPR*PPSARDCTDL*NRQR*VQQNI
SGMDSEVCHVMLP*SQNNLHYSWNKL*ITVPFL
IFLSGCSPIRPHLF*FYFLFTSLHSFTCSSEKT
*VLPALDNNCF*KL*SSYKRTVAQDSEFLKKKME
HVYYVANVFTLTWL*D*NHSSLL*HAEEII*GG
GRWMLSCHIKGYSIILAASILV*AFHC*RFEVT
*YALCS*LMWLENWY*IYSISRTENVMYFMHVNK
GMTCSCSTENGNWKSNTLCIPK*GLKHFVIFI*
IVRRLGAIS*SIFQYTV*YSTE*MMQVVNG*VI
N**LC**LIYFSSIKLHKPMS*LPGLISMGNNLL
*MQSCFLYILLGFASLFDIK**CKVRKSEYFAM
FS*SAQSVTG*HIA*PDLCRINKLFG*CSFNVL
HMILAALEFIDGLLGPSSFEMCLWSLRNLFSRCS
PCLTEISLHLVHLTAEKKQHGSNNGSKFAK*ST
VLVWELS*GCVEVTYLCGILSIH*NGFVQPFTL
MSI*MQQISFQVT*HE*IKVNAIG

Frame 2

QVRKLGDAVGRGVGLDRAAAASFTFLPWSPSGS
RCFSEPKGFRHSFTLPPAHDLPPSPALLVQSPI
CLVRRCCSEKEKEKGLTRIHSAPDVGSKPSGFG
LTSVLCSGRRRWRTDPRR*RGACVWQSWCETRQS
CPAAGIIKSFGRTFEHTPRE*GARRQAHTMALK
RINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATI
MGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTT
RIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLL
SICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRI
SREWTQKYAM*CYLKVRITCIIAGINFKLLFLF*
FSYPAAPLSDLIFFNFIFCLPPSIHSHAHLRRL
KFFQLWTITAFRNCKVVTREQLPKTQNF*KKKW
SMCIMWPMSSL*LGYETKTIPHCSNMLKKSSEGE
GDGCSVVTSKDTALF*QHPFLFKPSTVRDLRLH
DMLYAHN*CGWRIGIEFIASAEQKM*CILCMSI
KE*PVLVLQRMEIGSQTPFVFQNRVSNIL*FSFK
LLGGLELLVNLSSNTLFNIALNK*CKLSMDE*S
TNSSASN*FIFLQ*SCINQ*VSCLD*SVWETIF
CKCKAVFCIYCWDLLHCLTSNDDVKFERVNILPC
SVKVHSLLQVDTLLDLIYAELISYLDSVALMCC
T*YWQP*SS*MDFWDPAVLKCVYGV*EIYFPGA
APV*LKFLFTLYT*QLKKNNMGVIMGQNLQNKVL
FWCGSCHEAVLK*LIYVGY*VSIEMDLFSHLH*
*AFKCNRYHFR*LNMNE*KSMLL

Sequence NM_181886

ACCAAGTGAGGAAACTGGGGGACGCTGTGGGGAGGGGCGTGGGGCTGGATCGCGCAGCGGCTGCTTCCTTTACCTTCCTCCCATGGTCTCCTTCCGGTTC
TCGATGCTTCTCTGAGCCTAAGGGTTTCCGCCACTCGTTCACCCTCCCCCCAGCTCATGATCTTCCTCCCTCCCCCGCCCTCCTGGTCCAATCTCCGATC
TGTTTAGTAAGAAGGTGCTGTTCCGAGAAGGAGAAGGAAAAGGGCTTGACACGTATTCACTCGGCCCCGGACGTGGGAAGCAAGCCGTCTGGCTTCGGCC
TCACATCGGTCCTGTGCTCGGGACGGCGGCGTTGGCGGACTGATCCGCGGCGGTGAAGAGAGGCCGGGAAGTTAAACTTGTAGCCACCACCTCCGCTCTT
CCCGTCACCCTCGCCCCCACTTCGGGCCGAAAGCACGGTACAGAGGCTGTTGGTGGCTTTGCCACGCCACCCCACCCACCCCGGATCGCGGCTGTCTTAA
GGGACCTGGATTCATCAGGGGCTCTTCGGGGCCTGTGCGAGTGCTGATCTGCTCCGTTTTTGCAAAAGGCGCCTGTGTCTGGCAGAGCTGGTGTGAGACG
AGACAATCCTGCCCCGCCGCCGGGATAATCAAGAGTTTTGGCCGGACCTTTGAGCATACACCGAGAGAGTGAGGAGCCAGACGACAAGCACACACTATGG
CGCTGAAACGGATTAATAAGGAACTTAGTGATTTGGCCCGTGACCCTCCAGCACAATGTTCTGCAGGTCCAGTTGGGGATGATATGTTTCATTGGCAAGC
CACAATTATGGGACCTAATGACAGCCCATATCAAGGCGGTGTATTCTTTTTGACAATTCATTTTCCTACAGACTACCCCTTCAAACCACCTAAGGTTGCA
TTTACAACAAGAATTTATCATCCAAATATTAACAGTAATGGCAGCATTTGTCTCGATATTCTAAGATCACAGTGGTCGCCTGCTTTAACAATTTCTAAAG
TTCTTTTATCCATTTGTTCACTGCTATGTGATCCAAACCCAGATGACCCCCTAGTGCCAGAGATTGCACGGATCTATAAAACAGACAGAGATAAGTACAA
CAGAATATCTCGGGAATGGACTCAGAAGTATGCCATGTGATGCTACCTTAAAGTCAGAATAACCTGCATTATAGCTGGAATAAACTTTAAATTACTGTTC
CTTTTTTGATTTTCTTATCCGGCTGCTCCCCTATCAGACCTCATCTTTTTTAATTTTATTTTTTGTTTACCTCCCTCCATTCATTCACATGCTCATCTGA
GAAGACTTAAGTTCTTCCAGCTTTGGACAATAACTGCTTTTAGAAACTGTAAAGTAGTTACAAGAGAACAGTTGCCCAAGACTCAGAATTTTTAAAAAAA
AAAATGGAGCATGTGTATTATGTGGCCAATGTCTTCACTCTAACTTGGTTATGAGACTAAAACCATTCCTCACTGCTCTAACATGCTGAAGAAATCATCT
GAGGGGGAGGGAGATGGATGCTCAGTTGTCACATCAAAGGATACAGCATTATTCTAGCAGCATCCATTCTTGTTTAAGCCTTCCACTGTTAGAGATTTGA
GGTTACATGATATGCTTTATGCTCATAACTGATGTGGCTGGAGAATTGGTATTGAATTTATAGCATCAGCAGAACAGAAAATGTGATGTATTTTATGCAT
GTCAATAAAGGAATGACCTGTTCTTGTTCTACAGAGAATGGAAATTGGAAGTCAAACACCCTTTGTATTCCAAAATAGGGTCTCAAACATTTTGTAATTT
TCATTTAAATTGTTAGGAGGCTTGGAGCTATTAGTTAATCTATCTTCCAATACACTGTTTAATATAGCACTGAATAAATGATGCAAGTTGTCAATGGATG
AGTGATCAACTAATAGCTCTGCTAGTAATTGATTTATTTTTCTTCAATAAAGTTGCATAAACCAATGAGTTAGCTGCCTGGATTAATCAGTATGGGAAAC
AATCTTTTGTAAATGCAAAGCTGTTTTTTGTATATACTGTTGGGATTTGCTTCATTGTTTGACATCAAATGATGATGTAAAGTTCGAAAGAGTGAATATT
TTGCCATGTTCAGTTAAAGTGCACAGTCTGTTACAGGTTGACACATTGCTTGACCTGATTTATGCAGAATTAATAAGCTATTTGGATAGTGTAGCTTTAA
TGTGCTGCACATGATACTGGCAGCCCTAGAGTTCATAGATGGACTTTTGGGACCCAGCAGTTTTGAAATGTGTTTATGGAGTTTAAGAAATTTATTTTCC
AGGTGCAGCCCCTGTCTAACTGAAATTTCTCTTCACCTTGTACACTTGACAGCTGAAAAAAAACAACATGGGAGTAATAATGGGTCAAAATTTGCAAAAT
AAAGTACTGTTTTGGTGTGGGAGTTGTCATGAGGCTGTGTTGAAGTGACTTATCTATGTGGGATATTGAGTATCCATTGAAATGGATTTGTTCAGCCATT
TACATTAATGAGCATTTAAATGCAACAGATATCATTTCAGGTGACTTAACATGAATGAATAAAAGTCAATGCTATTGGA
  • refseq_UBE2D3.F3 (forward primer)
  • refseq_UBE2D3.R3 (reverse primer)
  • Alternative acceptor

Frame 0

TK*GNWGTLWGGAWGWIAQRLLPLPSSHGLLPV
LDASLSLRVSATRSPSPQLMIFLPPPPSWSNLRS
V**EGAVPRRRRKRA*HVFTRPRTWEASRLASA
SHRSCARDGGVGGLIRGGEERPGS*TCSHHLRS
SRHPRPHFGPKARYRGCWWLCHATPPTPDRGCLK
GPGFIRGSSGPVRVLICSVFAKGACVWQSWCET
RQSCPAAGIIKSFGRTFEHTPRE*GARRQAHTM
ALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQA
TIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVA
FTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISK
VLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYN
RISREWTQKYAM*CYLKVRITCIIAGINFKLLF
LF*FSYPAAPLSDLIFFNFIFCLPPSIHSHAHL
RRLKFFQLWTITAFRNCKVVTREQLPKTQNF*KK
KWSMCIMWPMSSL*LGYETKTIPHCSNMLKKSS
EGEGDGCSVVTSKDTALF*QHPFLFKPSTVRDL
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SIKE*PVLVLQRMEIGSQTPFVFQNRVSNIL*F
SFKLLGGLELLVNLSSNTLFNIALNK*CKLSMD
E*STNSSASN*FIFLQ*SCINQ*VSCLD*SVWET
IFCKCKAVFCIYCWDLLHCLTSNDDVKFERVNI
LPCSVKVHSLLQVDTLLDLIYAELISYLDSVAL
MCCT*YWQP*SS*MDFWDPAVLKCVYGV*EIYFP
GAAPV*LKFLFTLYT*QLKKNNMGVIMGQNLQN
KVLFWCGSCHEAVLK*LIYVGY*VSIEMDLFSH
LH**AFKCNRYHFR*LNMNE*KSMLL

Frame 1

PSEETGGRCGEGRGAGSRSGCFLYLPPMVSFRF
SMLL*A*GFPPLVHPPPSS*SSSLPRPPGPISD
LFSKKVLFREGEGKGLDTYSLGPGRGKQAVWLRP
HIGPVLGTAALAD*SAAVKRGREVKLVATTSAL
PVTLAPTSGRKHGTEAVGGFATPPHPPRIAAVL
RDLDSSGALRGLCEC*SAPFLQKAPVSGRAGVRR
DNPAPPPG*SRVLAGPLSIHRESEEPDDKHTLW
R*NGLIRNLVIWPVTLQHNVLQVQLGMICFIGK
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CAAHDTGSPRVHRWTFGTQQF*NVFMEFKKFIF
QVQPLSN*NFSSPCTLDS*KKTTWE**WVKICKI
KYCFGVGVVMRLC*SDLSMWDIEYPLKWICSAI
YINEHLNATDIISGDLT*MNKSQCYW

Frame 2

QVRKLGDAVGRGVGLDRAAAASFTFLPWSPSGS
RCFSEPKGFRHSFTLPPAHDLPPSPALLVQSPI
CLVRRCCSEKEKEKGLTRIHSAPDVGSKPSGFG
LTSVLCSGRRRWRTDPRR*REAGKLNL*PPPPLF
PSPSPPLRAESTVQRLLVALPRHPTHPGSRLS*
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NLL*MQSCFLYILLGFASLFDIK**CKVRKSEY
FAMFS*SAQSVTG*HIA*PDLCRINKLFG*CSFN
VLHMILAALEFIDGLLGPSSFEMCLWSLRNLFS
RCSPCLTEISLHLVHLTAEKKQHGSNNGSKFAK
*STVLVWELS*GCVEVTYLCGILSIH*NGFVQPF
TLMSI*MQQISFQVT*HE*IKVNAIG

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